Les comités de PEN International incluent le Comité des écrivains pour la paix, le Comité de traduction et des droits linguistiques, le Comité des femmes écrivains, et le Comité des écrivains en prison. Chaque Comité possède une chaire internationale qui rend compte de ses activités auprès du Conseil de PEN International, et bénéficie dans ses travaux du soutien du secrétariat. Tous les Comités, à l'exception du Comité des écrivains en prison, sont basés dans un centre PEN.
Les Comités orientent le dialogue et les programmes sur des problématiques et des thématiques communes à échelle internationale, régionale, et entre chaque centre. Chacun d'entre eux choisi dans quel domaine d'activité des Comités il souhaiterait participer et nomme un représentant en chef.
PEN International travaille avec plusieurs organisations affiliées qui défendent les objectifs et les principes de notre organisation, tout en soutenant ses différents secteurs d'activités.